За регистр наименований таблиц в MySQL отвечает опция lower_case_table_names

Опция находится в настройках MySQL, в файле my.ini 

По-умолчанию lower_case_table_names = 1

Для того, чтобы в регистре присутствовали заглавные буквы необходимо значение параметра изменить на 2

lower_case_table_names = 2

Далее, сохраняем файл, перезагружаем сервер и радуемся)