Есть способ конечно переименовать папки вручную...

А что если папок много да еще и в папках много подпапок? (тофтология =))

В такой ситуации нам нужно создать виртуальный диск главной папки (предварительно переименовав ее) командой:

subst q: путь_к_папке

где q: - имя виртуального диска,

путь_к_папке например - C:\ваша_папка

После чего заходим в этот диск и делаем архив всего содержимого с новым именем, с параметром "Удалить файлы после упаковки".

После этих операций папки с длинными названиями удалятся сами.

Если некоторые папки остались, нужно снова создать архив, до полного удаления.